Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms