Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprkP35822 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms