Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cd28P31041 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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