Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms