Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Rnf141-209ENSMUST00000177236 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms