Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
P10404 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms