Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P01649 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P01649 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms