Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm8356J3QPD3 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms