Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20795J3QP49 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20795J3QP49 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20795J3QP49 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20795J3QP49 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20795J3QP49 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20795J3QP49 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20795J3QP49 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20795J3QP49 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20795J3QP49 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20795J3QP49 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20795J3QP49 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20795J3QP49 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms