Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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