Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm13358-201ENSMUST00000121427 569 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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