Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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