Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Dnajc28Q8VCE1 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Dnajc28Q8VCE1 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Dnajc28Q8VCE1 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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