Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 CT030732.1-201ENSMUST00000226885 246 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm5407-201ENSMUST00000080694 747 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 1700021F13Rik-202ENSMUST00000202665 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms