Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Trafd1Q3UDK1 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241.8 ms