Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ttc21bQ0HA38 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms