Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SftpdP50404 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SftpdP50404 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms