Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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