Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
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