Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
RxraP28700 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxraP28700 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxraP28700 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RxraP28700 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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