Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P20040 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P20040 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P20040 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P20040 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
P20040 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P20040 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P20040 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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