Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
P10404 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
P10404 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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