Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm3618-201ENSMUST00000112726 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm15520-201ENSMUST00000132097 1203 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm21965-201ENSMUST00000177770 384 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm11109-201ENSMUST00000180289 384 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm6989-201ENSMUST00000218409 654 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Smim18J3QNP2 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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