Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms