Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21060J3KMU4 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms