Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Fam229b-206ENSMUST00000136546 592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm17979-201ENSMUST00000196646 611 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Selenok-ps7-201ENSMUST00000197069 283 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm2098-201ENSMUST00000189146 1763 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm20539-201ENSMUST00000174811 1384 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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Rabgef1Q9JM13 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip8-213ENSMUST00000180305 369 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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