Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rnft1Q9DCN7 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms