Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pacsin3Q99JB8 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms