Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Top1mtQ8R4U6 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms