Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Prpf39Q8K2Z2 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms