Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc28aQ8CEI3 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc28aQ8CEI3 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc28aQ8CEI3 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc28aQ8CEI3 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc28aQ8CEI3 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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