Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NischQ80TM9 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms