Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Usp48Q3V0C5 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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Usp48Q3V0C5 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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Usp48Q3V0C5 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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Usp48Q3V0C5 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Usp48Q3V0C5 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Usp48Q3V0C5 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Usp48Q3V0C5 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Usp48Q3V0C5 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Usp48Q3V0C5 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
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Usp48Q3V0C5 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp48Q3V0C5 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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