Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc21bQ0HA38 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc21bQ0HA38 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms