Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rpl28P41105 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms