Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprkP35822 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprkP35822 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprkP35822 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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