Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprmP28828 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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PtprmP28828 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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