Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RxraP28700 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
RxraP28700 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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