Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Ift81-201ENSMUST00000031426 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms