Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Pitpnm2os2-202ENSMUST00000162577 744 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P10404 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P10404 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms