Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb1P09055 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb1P09055 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms