Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms