Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd2V9GX34 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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