Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cib2Q9Z309 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cib2Q9Z309 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms