Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl8Q9Z121 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms