Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Itsn1Q9Z0R4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itsn1Q9Z0R4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itsn1Q9Z0R4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itsn1Q9Z0R4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itsn1Q9Z0R4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Itsn1Q9Z0R4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itsn1Q9Z0R4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itsn1Q9Z0R4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itsn1Q9Z0R4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itsn1Q9Z0R4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itsn1Q9Z0R4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms