Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Carm1Q9WVG6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Carm1Q9WVG6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms