Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam50bQ9WTJ8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms