Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms