Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf4Q9QZS2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf4Q9QZS2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms